Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
C9orf16Q9BUW7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C9orf16Q9BUW7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms