Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PCGF1Q9BSM1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms