Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MESP1Q9BRJ9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms