Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBA1CQ9BQE3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBA1CQ9BQE3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms