Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIPSNAP1Q9BPW8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms