Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TCF12Q99081 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TCF12Q99081 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms