Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMTK3Q96Q04 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMTK3Q96Q04 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms