Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX3

ZNF48, Zinc finger protein 48, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 618 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF48Q96MX3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF48Q96MX3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF48Q96MX3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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