Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
DCHS1Q96JQ0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DCHS1Q96JQ0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms