Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TIMD4Q96H15 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms