Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CMTM5Q96DZ9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms