Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TM4SF18Q96CE8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms