Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC8Q96B26 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms