Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
UTP4Q969X6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms