Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM54Q969K7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms