Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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UBXN4Q92575 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN4Q92575 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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UBXN4Q92575 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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UBXN4Q92575 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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UBXN4Q92575 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN4Q92575 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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