Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C17orf50Q8WW18 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms