Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
AMER3Q8N944 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms