Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LMNTD2Q8IXW0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMNTD2Q8IXW0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms