Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDKL3Q8IVW4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL3Q8IVW4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDKL3Q8IVW4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms