Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBE3BQ7Z3V4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms