Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATG9AQ7Z3C6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms