Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG3Q6UXM1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms