Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC171Q6TFL3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC171Q6TFL3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms