Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SDE2Q6IQ49 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms