Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CARMIL2Q6F5E8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms