Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ANKRD40Q6AI12 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ANKRD40Q6AI12 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms