Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATG16L1Q676U5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms