Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms