Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TDRD12Q587J7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TDRD12Q587J7 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms