Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDCA8Q53HL2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDCA8Q53HL2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms