Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RFTN2Q52LD8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RFTN2Q52LD8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms