Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL38Q2WGJ6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms