Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC27Q2M243 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC27Q2M243 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms