Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COL24A1Q17RW2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COL24A1Q17RW2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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