Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLPPQ16740 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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