Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FXNQ16595 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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FXNQ16595 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FXNQ16595 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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