Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CSRP2Q16527 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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