Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ASIC2Q16515 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms