Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SKIV2LQ15477 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SKIV2LQ15477 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms