Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RYR3Q15413 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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