Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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