Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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