Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PDK3Q15120 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDK3Q15120 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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