Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GAPVD1Q14C86 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GAPVD1Q14C86 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms