Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHPRHQ149N8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SHPRHQ149N8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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