Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB39AQ14964 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RAB39AQ14964 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB39AQ14964 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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RAB39AQ14964 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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