Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RRP1BQ14684 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RRP1BQ14684 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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