Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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EBI3Q14213 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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EBI3Q14213 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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EBI3Q14213 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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EBI3Q14213 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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EBI3Q14213 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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EBI3Q14213 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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EBI3Q14213 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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EBI3Q14213 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
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EBI3Q14213 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
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EBI3Q14213 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
EBI3Q14213 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EBI3Q14213 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EBI3Q14213 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
EBI3Q14213 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EBI3Q14213 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EBI3Q14213 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EBI3Q14213 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EBI3Q14213 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EBI3Q14213 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
EBI3Q14213 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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EBI3Q14213 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
EBI3Q14213 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms