Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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